绩效考核奖惩制度中的惩罚机制主要包括以下几种类型：
警告：对绩效不达标的员工进行口头或书面的警告，提醒其注意工作表现，避免再次出现问题。
降级：将表现不佳的员工降低岗位级别或职位，降低其权利和责任，以达到惩罚和警示的目的。
绩效扣减：根据员工的绩效表现，扣减相应的奖金或绩效工资，直接影响到员工的经济利益。
停薪留职：暂停员工的薪资待遇，但保留其工作岗位，要求其在一定期限内改进表现，否则会被解雇。
训诫：通过组织培训或个别辅导，帮助员工改进工作表现，引导其树立正确的工作态度。
调岗：将绩效不佳的员工调至其他部门或岗位，以期在新的环境中激发其工作潜力。
辞退：对于严重影响企业利益或无法改进的员工，采取辞退措施，终止与其的劳动合同。
在实际操作中，管理者应根据具体情况选择合适的惩罚措施，并在执行惩罚时要公平、公正、透明，同时结合奖励机制，形成正向激励和负向惩罚的完整体系，以促进员工的绩效提升和团队的整体发展。